Журнал Юный ученый публикует научные статьи, написанные школьниками под руководством учителей. Тематический рубрикатор журнала построен на основе новых федеральных стандартов и включает в себя все обязательные предметные области и учебные предметы, в рамках которых школьники занимаются научной деятельностью.